-ceRNA调控网络

Demo结果

Demo结果解读

通过展示不同基因的ceRNA的调控机制，从中挖掘出实验组与对照组不同类型的ceRNA机制，找到特异性的ceRNA。线代表不同的microRNA，蓝色为mRNA，红色为circRNA，绿色为lncRNA。

ceRNA调控网络介绍

建立了一个计算的机制来使circRNA(lncRNA)作为ceRNA来保护mRNA不受miRNA的降解。基于基因的表达值，通过回归模型分析以及种子序列的匹配的方法，建立microRNA的海绵吸附作用的调控网络。

分析要求

1. 客户需要提供microRNA表达数据（可选），circRNA(lncRNA)表达数据(必选)，mRNA表达数据（必选）；
2. 每组数据3个或3个以上生物学重复。

提供结果

1. 图片文件（Network图），包括png、PDF格式；
2. Cytocape文件：可以cytoscape打开进行细节调整；
3. 文本文件：基因之间ceRNA调控关系，调控分数，circRNA（lncRNA）microRNA,mRNA核心调控关系的排序。